重庆 (4)
1.缙云山国家级自然保护区
2.大巴山国家级自然保护区
3.长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
4.金佛山国家级自然保护区
四川 (23)
1.龙溪－虹口国家级自然保护区
2.白水河国家级自然保护区
3.攀枝花苏铁国家级自然保护区
4.画稿溪国家级自然保护区
5.王朗国家级自然保护区
6.唐家河国家级自然保护区
7.马边大风顶国家级自然保护区
8.长宁竹海国家级自然保护区
9.蜂桶寨国家级自然保护区
10.卧龙国家级自然保护区
11.九寨沟国家级自然保护区
12.小金四姑娘山国家级自然保护区
13.若尔盖湿地国家级自然保护区
14.贡嘎山国家级自然保护区
15.察青松多白唇鹿国家级自然保护区
16.亚丁国家级自然保护区
17.美姑大风顶国家级自然保护区
18.长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
19.米仓山国家级自然保护区
20.雪宝顶国家级自然保护区
21.花萼山国家级自然保护区
22.海子山国家级自然保护区(2008年1月14日)
23.长沙贡玛国家级自然保护区(2009年9月18日)
24.屏山县老君山（申请晋升）
