湖北 (11)
1.青龙山恐龙蛋化石群国家级自然保护区
2.神农架国家级自然保护区
3.五峰后河国家级自然保护区
4.石首糜鹿国家级自然保护区
5.长江天鹅洲白鱀豚国家级自然保护区
6.长江新螺段白鱀豚国家级自然保护区
7.星斗山国家级自然保护区
8.九宫山国家级自然保护区
9.七姊妹山国家级自然保护区(2008年1月14日)
10.洪湖湿地国家级自然保护区
11. 龙感湖国家级自然保护区(2009年9月18日)
湖南 (17)
1.炎陵桃源洞国家级自然保护区
2.东洞庭湖国家级自然保护区
3.壶瓶山国家级自然保护区
4.张家界大鲵国家级自然保护区
5.八大公山国家级自然保护区
6.莽山国家级自然保护区
7.永州都庞岭国家级自然保护区
8.小溪国家级自然保护区
9.黄桑国家级自然保护区
10.乌云界国家级自然保护区
11.鹰嘴界国家级自然保护区
12.南岳衡山国家级自然保护区
13.借母溪国家级自然保护区(2008年1月14日)
14.阳明山国家级自然保护区(2009年9月18日)
15.八面山国家级自然保护区(2008年1月14日)
16.六步溪国家级自然保护区(2009年9月18日)
17.舜皇山国家级自然保护区(2009年9月18日)
18.高望界省级自然保护区晋升国家级（进入公示期）
