而生物方式则没有上述缺点。某些天然存在于海洋或土壤中的活体微生物及其本身产生的活性物质酶类，通过生物化学反应，可以将石油的主要成分烃类物质，降解成二氧化碳和水，完全消除污染物，不会引起二次污染。与物理、化学方法相比，它对人和环境造成的影响小，且费用仅为传统物理、化学处理方式的30%～50%。
“如果微生物菌剂选择得好，石油污染物降解的最终产物就是水和二氧化碳，但如果选用不当，也会产生一些中间产物，比如有机酸、羧酸等，所以要有针对性地筛选有除污功能的微生物。”刘志恒提醒。
在环境治理过程中还少不了“极端微生物“来搭把手。刘志恒介绍，极端微生物是指那些在一般生物无法生存的条件下，如高酸、高碱、高温、低温等条件下能生存的微生物。比如嗜热微生物可以对高温排放废水直接处理，省去了冷却环节，大大节省开销。
国内菌剂有待产业化
环保用微生物菌剂的来源之一是从自然界中筛选优势菌种。
发达国家自20世纪七八十年代开始，在环保微生物菌剂领域投入了大量人力、物力，获得了巨大的经济、环境和社会效益。
在刘志恒看来，我国的环保用微生物菌剂的开发起步较晚，始终处于“追踪”人家的阶段。目前国内市场的环保用菌剂多为进口产品，如丹麦生物技术公司诺维信和日本EM研究机构的菌剂。日本琉球大学比嘉照夫教授1983年研制的EM(有效微生物群)技术，是采用独特工艺，将经过仔细筛选的好氧和厌氧性有益微生物，以适当比例混合培养发酵制成微生物活菌制剂，已经被多国广泛用于种植业、养殖业及环境净化。
进口菌剂种类多、针对性强、效果好，但价格较高。国内许多环保菌剂企业的产品为EM菌剂仿制品或由多种功能菌复配而成的菌剂，针对性不强;国内高校科研机构的研究较深入，也有一些自主产品，但研发成果与生产相脱离，能大规模推广应用的不多，能出口的更是寥寥无几。
警惕微生物发生变异
不过，微生物易随环境的改变而发生变异，在环境中应用的同时存在较大不确定性和潜在风险。
微生物体积小、面积大;吸收多、转化快;生长旺、繁殖快;适应强、变异快;分布广、种类多。根据这些特点，菌剂使用必须高度注意环境安全，警惕其代谢产物对环境生态的影响。刘志恒强调，很多降解特性很强的菌株属于基因工程构建的工程菌，目前虽未有发生安全事故的报道，但其安全性及释放到环境中对生态的影响，必须经过生物安全检验。随着基因工程菌种越来越多，对环境的现实影响、滞后影响要持续关注。
微生物具有转化快、繁殖快、适应性强、变异快等特点，所以使用菌剂必须高度注意环境安全，警惕其代谢产物对环境的影响。
