河南 (11)
1.黄河湿地国家级自然保护区
2.豫北黄河故道湿地鸟类国家级自然保护区
3.焦作太行山猕猴国家级自然保护区
4.南阳恐龙蛋化石群国家级自然保护区
5.伏牛山国家级自然保护区
6.宝天曼国家级自然保护区
7.鸡公山国家级自然保护区
8.董寨国家级自然保护区
9.连康山国家级自然保护区
10.小秦岭国家级自然保护区
11.丹江湿地国家级自然保护区
山西 (5)
1.阳城莽河猕猴国家级自然保护区
2.芦芽山国家级自然保护区
3.庞泉沟国家级自然保护区
4.历山国家级自然保护区
5.五鹿山国家级自然保护区
陕西 (12)
1.周至国家级自然保护区
2.太白山国家级自然保护区
3.长青国家级自然保护区
4.佛坪国家级自然保护区
5.牛背梁国家级自然保护区
6.汉中朱鹮国家级自然保护区
7.子午岭国家级自然保护区
8.化龙山国家级自然保护区
9.天华山国家级自然保护区(2008年1月14日)
10.青木川国家级自然保护区(2009年9月18日)
11.桑园国家级自然保护区(2009年9月18日)
12.陇县秦岭细鳞鲑国家级自然保护区(2009年9月18日)
陕西米仓山省级自然保护区、陕西延安黄龙褐马鸡自然保护区晋升国家级
（公示日期：2009年12月17日—2009年12月29日）
