涉外税收管理机关接到企业退（免）税申报表后，经审核无误，报上级涉外税收管理机关审批后办理；对于采用“免、抵、退”办法以及采取先征后退办法应予办理退税的，经上级涉外税收管理机关审查后，送同级进出口税收管理机关审批核准办理退库。 

      负责出口退税审核的税务机关在接到出口企业的退税申报表时，亦必须严格按照出口退税规定认真审核，确认无误后，逐级报请有权审批的税务机关审批，只有在批准后，才可填写《收入退还书》，送当地银行（国库）办理退税。

      出口退税审核的主要内容有：出口报关单原始单据、进项税额原始单据、出口货物销售帐簿和应交税金帐簿等。

      台商投资企业提出的退税申请手续齐备、内容真实的，当地涉外税收管理机关必须自接到申请之日起，15日内审核完毕；上一级涉外税收管理机关必须自接到有关材料后15日内审批完毕；进出口税收管理机关必须在接到有关材料后，30日内办完有关退税手续。

4、税款退付与退税清算

（一）税款退付是在出口退税申报和审批之后，银行依据《收入退还书》将出口退税款从国库退付到出口企业的开户银行帐户的行为。出口货物在办理退税手续后，如发生退关、国外退货或转为内销，企业必须向所在地主管出口退税的税务机关办理申报手续，补交已退（免）的税款。

（二）退税清算。出口企业要于年度终了后三个月内，进行上一年度出口退税的清算，按规定期限向主管退税机关报送“清算表”及相关资料由主管税务机关进行全面清查。主管退税机关在出口企业清算结束后两个月内，对企业上报清算报表的清算资料进行清算核查，并向出口企业发出《清算情况通知书》说明以下问题：

1、出口企业的性质和清算范围，出口货物的品种、数量及销售额，清算后出口企业应退税款、已退税款。

2、清算中发现的问题，多退、少退、错退的金额。

3、清算处理结果及意见。